Ученые связали десятки новых генов с риском болезни Крона
Трехмерное картирование ДНК редких иммунных клеток помогло обнаружить десятки генов, которые ранее не связывали с болезнью Крона.
Источник: Новости науки.
МОСКВА, 5 августа /Новости науки/. Международная группа ученых связала десятки ранее неизвестных генов с риском развития болезни Крона. Об этом говорится в исследовании в Nature Genetics.
Открытие поможет лучше понять причины хронического воспаления кишечника. Многие связанные с болезнью варианты ДНК находятся не внутри генов, а в регулирующих областях, поэтому установить их влияние обычными методами сложно.
«Особенно неожиданной оказалась связь с CLN3 — геном, наиболее известным своей ролью в развитии нейродегенеративной болезни Баттена. Эксперименты показали, что он напрямую влияет на интенсивность выработки клетками воспалительных сигналов», — рассказала один из руководителей исследования Валерия Малышева.
Ученые изучили врожденные лимфоидные клетки третьего типа — ILC3. Эти редкие иммунные клетки участвуют в воспалении и восстановлении тканей кишечника. Исследователи определили, как ДНК складывается внутри них и какие удаленные друг от друга участки генома вступают в физический контакт.
Для этого специалисты использовали миниатюрную версию метода Capture Hi-C, позволяющую исследовать трехмерную структуру генома при небольшом количестве клеток. В результате удалось определить более 100 генов, на работу которых могут влиять варианты ДНК, связанные с болезнью Крона. Около половины этих генов уже были известны ученым, остальные ранее с заболеванием не связывали.
Болезнь Крона представляет собой хроническое воспалительное заболевание, которое может поражать разные отделы пищеварительного тракта. Его развитие зависит от сочетания наследственных факторов, особенностей иммунной системы и внешней среды. Новая работа показывает, что для поиска механизмов заболевания необходимо учитывать не только последовательность ДНК, но и ее пространственную укладку внутри клетки.
Открытие поможет лучше понять причины хронического воспаления кишечника. Многие связанные с болезнью варианты ДНК находятся не внутри генов, а в регулирующих областях, поэтому установить их влияние обычными методами сложно.
«Особенно неожиданной оказалась связь с CLN3 — геном, наиболее известным своей ролью в развитии нейродегенеративной болезни Баттена. Эксперименты показали, что он напрямую влияет на интенсивность выработки клетками воспалительных сигналов», — рассказала один из руководителей исследования Валерия Малышева.
Ученые изучили врожденные лимфоидные клетки третьего типа — ILC3. Эти редкие иммунные клетки участвуют в воспалении и восстановлении тканей кишечника. Исследователи определили, как ДНК складывается внутри них и какие удаленные друг от друга участки генома вступают в физический контакт.
Для этого специалисты использовали миниатюрную версию метода Capture Hi-C, позволяющую исследовать трехмерную структуру генома при небольшом количестве клеток. В результате удалось определить более 100 генов, на работу которых могут влиять варианты ДНК, связанные с болезнью Крона. Около половины этих генов уже были известны ученым, остальные ранее с заболеванием не связывали.
Болезнь Крона представляет собой хроническое воспалительное заболевание, которое может поражать разные отделы пищеварительного тракта. Его развитие зависит от сочетания наследственных факторов, особенностей иммунной системы и внешней среды. Новая работа показывает, что для поиска механизмов заболевания необходимо учитывать не только последовательность ДНК, но и ее пространственную укладку внутри клетки.
