Ученые научились выявлять до 4 тысяч белков в одной иммунной клетке
Европейские ученые разработали метод, который позволяет выявлять до 4000 белков в одной иммунной клетке крови человека. Новый подход также помогает различать моноциты, Т-клетки и активированные лимфоциты по их белковым маркерам.
Источник: Новости науки
МОСКВА, 21 сентября /Новости науки/. Европейские ученые разработали метод, который позволяет выявлять до 4 тысяч белков в одной иммунной клетке крови человека. Об этом говорится в статье, опубликованной в Nature Communications.
«При применении к очень небольшим мононуклеарным клеткам периферической крови человека мы выявили до 4000 белков на клетку, включая ключевые маркеры, позволяющие различать моноциты, Т-клетки и активированные лимфоциты в неоднородных популяциях, что показывает: протеомика отдельных клеток теперь позволяет напрямую исследовать клинически значимые первичные образцы с высокой глубиной и точностью», — говорится в статье.
Метод применили к мононуклеарным клеткам периферической крови человека. Исследователям удалось обнаружить белковые маркеры, по которым можно различать моноциты, Т-клетки и активированные лимфоциты даже в неоднородной смеси клеток.
Сначала возможности нового подхода проверили на клетках HeLa. В одной такой клетке исследователи смогли количественно определять до 7000 белков. Метод при этом позволяет анализировать более 100 образцов в сутки.
Высокой чувствительности удалось достичь благодаря улучшенной подготовке образцов с небольшим количеством исходного материала, усовершенствованной жидкостной хроматографии и масс-спектрометру Orbitrap Astral Zoom. Исследователи смогли обнаружить тысячи белков, присутствующих в небольшом количестве и не выявлявшихся в предыдущих исследованиях отдельных клеток.
Анализ отдельных клеток
Протеомика отдельных клеток позволяет изучать набор белков в каждой клетке отдельно. Одной из основных трудностей такого анализа до сих пор оставалось получение подробных и воспроизводимых данных из очень малого количества материала.
Результаты исследования показывают, что глубокий анализ белков теперь возможен и в небольших первичных клетках человека. В клетках крови новый метод позволил не только выявить тысячи белков, но и обнаружить маркеры, различающие несколько типов иммунных клеток.
По данным исследования, достигнутая глубина и точность анализа позволяют применять протеомику отдельных клеток для непосредственного изучения клинически значимых первичных образцов.
«При применении к очень небольшим мононуклеарным клеткам периферической крови человека мы выявили до 4000 белков на клетку, включая ключевые маркеры, позволяющие различать моноциты, Т-клетки и активированные лимфоциты в неоднородных популяциях, что показывает: протеомика отдельных клеток теперь позволяет напрямую исследовать клинически значимые первичные образцы с высокой глубиной и точностью», — говорится в статье.
Метод применили к мононуклеарным клеткам периферической крови человека. Исследователям удалось обнаружить белковые маркеры, по которым можно различать моноциты, Т-клетки и активированные лимфоциты даже в неоднородной смеси клеток.
Сначала возможности нового подхода проверили на клетках HeLa. В одной такой клетке исследователи смогли количественно определять до 7000 белков. Метод при этом позволяет анализировать более 100 образцов в сутки.
Высокой чувствительности удалось достичь благодаря улучшенной подготовке образцов с небольшим количеством исходного материала, усовершенствованной жидкостной хроматографии и масс-спектрометру Orbitrap Astral Zoom. Исследователи смогли обнаружить тысячи белков, присутствующих в небольшом количестве и не выявлявшихся в предыдущих исследованиях отдельных клеток.
Анализ отдельных клеток
Протеомика отдельных клеток позволяет изучать набор белков в каждой клетке отдельно. Одной из основных трудностей такого анализа до сих пор оставалось получение подробных и воспроизводимых данных из очень малого количества материала.
Результаты исследования показывают, что глубокий анализ белков теперь возможен и в небольших первичных клетках человека. В клетках крови новый метод позволил не только выявить тысячи белков, но и обнаружить маркеры, различающие несколько типов иммунных клеток.
По данным исследования, достигнутая глубина и точность анализа позволяют применять протеомику отдельных клеток для непосредственного изучения клинически значимых первичных образцов.
