Ученые выяснили как изменения Y хромосомы влияют на раковые клетки
Ученые выяснили, что при раке у мужчин отдельные участки Y-хромосомы могут исчезать. Такие изменения затрагивают процессы, связанные с ростом опухоли и реакцией иммунной системы на раковые клетки.
Источник: Новости науки
МОСКВА, 29 сентября /Новости науки/. Ученые обнаружили, что раковые клетки у мужчин могут терять отдельные участки Y-хромосомы, что влияет на процессы роста опухоли и иммунный ответ организма. Об этом сообщается в статье, опубликованной в Communications Biology.
Исследователи проанализировали данные секвенирования генома и активности генов в 160 клеточных линиях рака, полученных от мужчин. Использование именно раковых клеточных линий позволило исключить влияние обычных клеток, которые в образцах опухолей могут затруднять обнаружение генетических изменений.
Для оценки степени утраты Y-хромосомы специалисты разработали показатель Y EroSion Score. Он позволил рассматривать ее потерю не только как полное исчезновение хромосомы, но и как постепенный процесс, при котором одни ее участки утрачиваются, а другие сохраняются.
Анализ выявил 24 белок-кодирующих гена Y-хромосомы, которые неоднократно отсутствовали в исследованных раковых клетках. Пятнадцать из них также оказались утраченными как минимум в одном из двух дополнительных наборов данных, включавших результаты изучения опухолей мочевого пузыря и данные различных видов рака.
Исследователи сравнили полученные результаты с данными геномов здоровых мужчин и не обнаружили у них таких же изменений Y-хромосомы. Это указывает на то, что выявленные потери возникают со временем, а не передаются по наследству.
Утрата отдельных участков Y-хромосомы была связана с изменениями активности генов по всему геному. Эти изменения затрагивали процессы, связанные со стрессовыми реакциями клеток, их ростом, движением и работой иммунной системы. При этом некоторые участки Y-хромосомы сохранялись даже в клетках со значительной ее утратой.
Авторы отмечают, что потеря Y-хромосомы ранее часто рассматривалась как единое событие — хромосома либо присутствует, либо отсутствует. Новые данные показывают более сложную картину, при которой раковые клетки могут выборочно терять определенные участки и сохранять другие.
Исследователи считают, что понимание того, какие именно участки Y-хромосомы исчезают в опухолевых клетках и как это отражается на работе других генов, может помочь лучше понять развитие опухолей. Однако результаты, полученные преимущественно на клеточных линиях, еще необходимо подтвердить при изучении первичных опухолей пациентов.
Исследователи проанализировали данные секвенирования генома и активности генов в 160 клеточных линиях рака, полученных от мужчин. Использование именно раковых клеточных линий позволило исключить влияние обычных клеток, которые в образцах опухолей могут затруднять обнаружение генетических изменений.
Для оценки степени утраты Y-хромосомы специалисты разработали показатель Y EroSion Score. Он позволил рассматривать ее потерю не только как полное исчезновение хромосомы, но и как постепенный процесс, при котором одни ее участки утрачиваются, а другие сохраняются.
Анализ выявил 24 белок-кодирующих гена Y-хромосомы, которые неоднократно отсутствовали в исследованных раковых клетках. Пятнадцать из них также оказались утраченными как минимум в одном из двух дополнительных наборов данных, включавших результаты изучения опухолей мочевого пузыря и данные различных видов рака.
Исследователи сравнили полученные результаты с данными геномов здоровых мужчин и не обнаружили у них таких же изменений Y-хромосомы. Это указывает на то, что выявленные потери возникают со временем, а не передаются по наследству.
Утрата отдельных участков Y-хромосомы была связана с изменениями активности генов по всему геному. Эти изменения затрагивали процессы, связанные со стрессовыми реакциями клеток, их ростом, движением и работой иммунной системы. При этом некоторые участки Y-хромосомы сохранялись даже в клетках со значительной ее утратой.
Авторы отмечают, что потеря Y-хромосомы ранее часто рассматривалась как единое событие — хромосома либо присутствует, либо отсутствует. Новые данные показывают более сложную картину, при которой раковые клетки могут выборочно терять определенные участки и сохранять другие.
Исследователи считают, что понимание того, какие именно участки Y-хромосомы исчезают в опухолевых клетках и как это отражается на работе других генов, может помочь лучше понять развитие опухолей. Однако результаты, полученные преимущественно на клеточных линиях, еще необходимо подтвердить при изучении первичных опухолей пациентов.
